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當科學狂人遇上機器學習:基因組測序竟能準確預測長相!

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放大字體  縮小字體 發布日期:2017-09-13   瀏覽次數:512
核心提示:文特爾博士的團隊發明,僅僅經由過程剖析基因組信息,我們就可以復原出人的長相。相干研討結果揭橥在了威望迷信期刊《美國國度迷信院院刊》(PNAS)上。克萊格文特爾(Craig Venter)博士是一位徹徹底底的「迷信狂人

文特爾博士的團隊發明,僅僅經由過程剖析基因組信息,我們就可以復原出人的長相。相干研討結果揭橥在了威望迷信期刊《美國國度迷信院院刊》(PNAS)上。

克萊格·文特爾(Craig Venter)博士是一位徹徹底底的「迷信狂人」。幾十年前,他創建的 Celera Genomics 曾以一家公司之力,加速了「人類基因組籌劃」的成長。他自己也于 2000 年和美國 NIH 擔任人弗朗西斯·柯林斯(Francis Collins)博士一道,配合宣告了人類基因組草圖的完成。接上去的 10 多年里,文特爾博士還做出了很多驚世駭俗的研討:他的私家游艇在 2006 年完成了周游世界之旅,并活著界各地搜集了水樣,用于剖析陸地微生物的構成;客歲,他的分解生物學小組又發明了具有最小基因組的生物,讓人們從新審閱哪些基因對性命才是相當主要。

克萊格·文特爾博士(圖片起源:Forbes)

昔日,這名迷信狂人的一項研討再次引爆了學術圈——文特爾博士的團隊發明,僅僅經由過程剖析基因組信息,我們就可以復原出人的長相。這項研討揭橥在了著名學術期刊《美國國度迷信院院刊》(PNAS)上。

在本年于圣地亞哥舉行的一場會議上,文特爾博士提出了一個不雅點——我們的基因組里記載了關于我們的一切。這包含我們能否輕易得肺癌,對咖啡因的降解能否夠快,這些信息里也包含我們的長相。

很多人對文特爾博士的不雅點持有保存立場。一方面來講,罹患肺癌的風險與咖啡因的降解才能面前有著明白的基因,這些信息切實其實可以從基因組里取得。可是長相遠沒有那末簡略:五官尺寸,面龐比例,脂肪厚度,毛發密度等一系列身分,都邑極年夜地影響一小我的長相。豈非我們還能從基因組里讀出那末多的信息不成?

文特爾博士告知你,能!

這項試驗的設計表示圖(圖片起源:《PNAS》)

在一項研討中,迷信家們招募了 1061 名來自分歧種族,有著分歧祖源的自愿者。這些自愿者先接收了全基因組測序,并在隨后的統計中,供給了臉部構造、膚色、年紀、身高、和體重等小我數據。應用這些信息,迷信家們開辟了一款機械進修的模子,并教會這個算法若何將基因組中的特點序列與人類的表面停止接洽。

在經由一系列的調試后,迷信家們發明,將年紀與 BMI 斟酌進長相的模仿后,精確度有了很年夜的進步。而終究的模仿成果,精確得讓人覺得驚奇。

上邊是真實人臉,下邊是依據基因組信息猜測的人臉,二者出奇分歧(圖片起源:《PNAS》)

「我們的這個研討注解,你的基因組編碼了你的全體。雖然介入這項研討的人數無限,但它在概念上證實了這一點。我們信任,跟著研討人數的賡續增長,我們將能經由過程一小我的基因組,精確猜測他的全體。」文特爾博士說。

這固然是迷信上的一個嚴重沖破。這項研討注解,基因組里編碼的信息比我們想象得要多許多。癥結在于,我們能否有勝利解讀這些信息的才能。跟著機械進修技巧的普及,這在將來將不會是一個困難。

另外一個擔心則隨之而生。最近幾年來,面臨患者和通俗花費者的基因測序辦事愈來愈多,我們的基因組信息從未如斯普及。假如基因組信息可以或許反應一小我的一切,隱私的主要性就被提到了一個全新的高度。「我們擔憂"和研討機構還沒有充足認識到,在基因組學時期,我們須要更好的平安辦法和政策來掩護小我隱私,」文特爾博士說:「我們呼吁能有更多的剖析,更好的技巧處理計劃,和連續的商量。」

基因組學時期,我們的醫療將由 4 個「P」構成,它們代表了猜測、預防、個別化、人人介入(圖片起源:P4 Medicine)

不管如何,基因組學時期曾經到來。我們等待在新技巧的引領下,人類對本身的熟悉能更上一層樓。將來,每一個人的基因組信息都能獲得充足的掩護,并能精確地反應出一小我的安康風險,讓人早預防,早發明,并獲得最好的醫治。

參考材料:

[1] Identification of individuals by trait prediction using whole-genome sequencing data

[2] Researchers From Human Longevity Use Whole Genome Sequence Data And Machine Learning To Identify Individuals Through Face And Other

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